Pelo fato da música envolver e afetar muitas facetas do ser humano, e em função da grande diversidade de suas aplicações clínicas, a musicoterapia pode ser utilizada para se obter um grande espectro de mudanças terapêuticas.

As ondas cerebrais, bem como as ondas sonoras, são medidas em Hertz (ciclos por segundo) e os padrões de ondas cerebrais se relacionam com a atividade neuroquímica no cérebro (noradrenalina, endorfinas, serotonina). O cérebro tende a harmonizar ou alinhar seus pulsos de onda a pulsos externos, fenômeno conhecido como "condicionamento acústico de onda cerebral".

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As áreas abaixo relacionadas são as mais frequentes visadas como alvo de mudanças: